Protein–RNA interactions for Protein: P62306

SNRPF, Small nuclear ribonucleoprotein F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPFP62306 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRPFP62306 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRPFP62306 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRPFP62306 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRPFP62306 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRPFP62306 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRPFP62306 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRPFP62306 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRPFP62306 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRPFP62306 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRPFP62306 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRPFP62306 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRPFP62306 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRPFP62306 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRPFP62306 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRPFP62306 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRPFP62306 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRPFP62306 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRPFP62306 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRPFP62306 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRPFP62306 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRPFP62306 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRPFP62306 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRPFP62306 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRPFP62306 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRPFP62306 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRPFP62306 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRPFP62306 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRPFP62306 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRPFP62306 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRPFP62306 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRPFP62306 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRPFP62306 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRPFP62306 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRPFP62306 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRPFP62306 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRPFP62306 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRPFP62306 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRPFP62306 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRPFP62306 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRPFP62306 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRPFP62306 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRPFP62306 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRPFP62306 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRPFP62306 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRPFP62306 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRPFP62306 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRPFP62306 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRPFP62306 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRPFP62306 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRPFP62306 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRPFP62306 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRPFP62306 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRPFP62306 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRPFP62306 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRPFP62306 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRPFP62306 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRPFP62306 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRPFP62306 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms