Protein–RNA interactions for Protein: P62166

NCS1, Neuronal calcium sensor 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCS1P62166 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCS1P62166 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCS1P62166 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCS1P62166 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCS1P62166 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCS1P62166 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCS1P62166 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCS1P62166 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCS1P62166 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCS1P62166 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCS1P62166 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCS1P62166 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCS1P62166 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCS1P62166 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCS1P62166 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCS1P62166 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCS1P62166 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCS1P62166 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCS1P62166 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCS1P62166 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NCS1P62166 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCS1P62166 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCS1P62166 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCS1P62166 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NCS1P62166 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCS1P62166 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCS1P62166 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCS1P62166 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCS1P62166 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCS1P62166 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCS1P62166 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCS1P62166 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCS1P62166 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCS1P62166 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCS1P62166 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCS1P62166 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCS1P62166 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCS1P62166 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCS1P62166 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCS1P62166 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCS1P62166 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCS1P62166 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCS1P62166 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NCS1P62166 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NCS1P62166 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NCS1P62166 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NCS1P62166 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NCS1P62166 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NCS1P62166 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NCS1P62166 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NCS1P62166 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NCS1P62166 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NCS1P62166 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NCS1P62166 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NCS1P62166 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NCS1P62166 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NCS1P62166 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NCS1P62166 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NCS1P62166 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NCS1P62166 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NCS1P62166 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NCS1P62166 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NCS1P62166 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NCS1P62166 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NCS1P62166 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NCS1P62166 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NCS1P62166 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NCS1P62166 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NCS1P62166 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NCS1P62166 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NCS1P62166 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NCS1P62166 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NCS1P62166 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NCS1P62166 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NCS1P62166 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NCS1P62166 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NCS1P62166 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NCS1P62166 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NCS1P62166 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NCS1P62166 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NCS1P62166 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NCS1P62166 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NCS1P62166 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NCS1P62166 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NCS1P62166 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NCS1P62166 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NCS1P62166 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NCS1P62166 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NCS1P62166 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NCS1P62166 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NCS1P62166 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NCS1P62166 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NCS1P62166 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NCS1P62166 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NCS1P62166 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NCS1P62166 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NCS1P62166 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NCS1P62166 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NCS1P62166 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NCS1P62166 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms