Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMO4P61968 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LMO4P61968 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMO4P61968 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMO4P61968 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMO4P61968 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMO4P61968 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMO4P61968 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMO4P61968 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LMO4P61968 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMO4P61968 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMO4P61968 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMO4P61968 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LMO4P61968 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LMO4P61968 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LMO4P61968 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LMO4P61968 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LMO4P61968 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LMO4P61968 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMO4P61968 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMO4P61968 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMO4P61968 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMO4P61968 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMO4P61968 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMO4P61968 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LMO4P61968 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMO4P61968 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMO4P61968 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMO4P61968 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMO4P61968 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMO4P61968 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LMO4P61968 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMO4P61968 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMO4P61968 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMO4P61968 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LMO4P61968 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMO4P61968 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
LMO4P61968 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMO4P61968 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMO4P61968 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMO4P61968 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMO4P61968 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LMO4P61968 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMO4P61968 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LMO4P61968 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMO4P61968 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMO4P61968 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LMO4P61968 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LMO4P61968 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMO4P61968 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LMO4P61968 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LMO4P61968 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMO4P61968 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LMO4P61968 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LMO4P61968 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LMO4P61968 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMO4P61968 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMO4P61968 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMO4P61968 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMO4P61968 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LMO4P61968 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LMO4P61968 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO4P61968 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO4P61968 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO4P61968 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO4P61968 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO4P61968 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO4P61968 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO4P61968 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO4P61968 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO4P61968 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO4P61968 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO4P61968 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO4P61968 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO4P61968 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO4P61968 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO4P61968 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO4P61968 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO4P61968 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO4P61968 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO4P61968 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO4P61968 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO4P61968 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO4P61968 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO4P61968 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO4P61968 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO4P61968 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO4P61968 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO4P61968 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO4P61968 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO4P61968 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO4P61968 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO4P61968 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO4P61968 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO4P61968 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO4P61968 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO4P61968 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO4P61968 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO4P61968 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO4P61968 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms