Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCE1P61221 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCE1P61221 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCE1P61221 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCE1P61221 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCE1P61221 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCE1P61221 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCE1P61221 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCE1P61221 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCE1P61221 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCE1P61221 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCE1P61221 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCE1P61221 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCE1P61221 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCE1P61221 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCE1P61221 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCE1P61221 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCE1P61221 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCE1P61221 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCE1P61221 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCE1P61221 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCE1P61221 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCE1P61221 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCE1P61221 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCE1P61221 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCE1P61221 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCE1P61221 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCE1P61221 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms