Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNAP25P60880 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms