Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms