Protein–RNA interactions for Protein: P53978

HEF3, Elongation factor 3B, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HEF3P53978 SRB4YER022W 2064 nt2.89□□□□□ -1.95
HEF3P53978 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt2.89□□□□□ -1.95
HEF3P53978 YDR115WYDR115W 318 nt2.89□□□□□ -1.95
HEF3P53978 SDL1YIL167W 633 nt2.89□□□□□ -1.95
HEF3P53978 URB2YJR041C 3525 nt2.89□□□□□ -1.95
HEF3P53978 STE18YJR086W 333 nt2.89□□□□□ -1.95
HEF3P53978 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.89□□□□□ -1.95
HEF3P53978 YLR230WYLR230W 306 nt2.89□□□□□ -1.95
HEF3P53978 INP1YMR204C 1263 nt2.89□□□□□ -1.95
HEF3P53978 SCD5YOR329C 2619 nt2.89□□□□□ -1.95
HEF3P53978 LCL1YPL056C 306 nt2.89□□□□□ -1.95
HEF3P53978 FRE2YKL220C 2136 nt2.89□□□□□ -1.95
HEF3P53978 TOR1YJR066W 7413 nt2.88□□□□□ -1.95
HEF3P53978 JJJ2YJL162C 1752 nt2.88□□□□□ -1.95
HEF3P53978 PRS3YHL011C 963 nt2.88□□□□□ -1.95
HEF3P53978 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt2.88□□□□□ -1.95
HEF3P53978 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt2.88□□□□□ -1.95
HEF3P53978 LRP1YHR081W 555 nt2.88□□□□□ -1.95
HEF3P53978 YNL150WYNL150W 408 nt2.88□□□□□ -1.95
HEF3P53978 MEI5YPL121C 669 nt2.88□□□□□ -1.95
HEF3P53978 PCK1YKR097W 1650 nt2.88□□□□□ -1.95
HEF3P53978 EAP1YKL204W 1899 nt2.88□□□□□ -1.95
HEF3P53978 JSN1YJR091C 3276 nt2.87□□□□□ -1.95
HEF3P53978 DNF1YER166W 4716 nt2.87□□□□□ -1.95
HEF3P53978 SCY1YGL083W 2415 nt2.87□□□□□ -1.95
HEF3P53978 snR84snR84 550 nt2.87□□□□□ -1.95
HEF3P53978 YER066C-AYER066C-A 501 nt2.87□□□□□ -1.95
HEF3P53978 PEA2YER149C 1263 nt2.87□□□□□ -1.95
HEF3P53978 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt2.87□□□□□ -1.95
HEF3P53978 CWC24YLR323C 780 nt2.87□□□□□ -1.95
HEF3P53978 NCS2YNL119W 1482 nt2.87□□□□□ -1.95
HEF3P53978 TMA64YDR117C 1698 nt2.87□□□□□ -1.95
HEF3P53978 RIX1YHR197W 2292 nt2.87□□□□□ -1.95
HEF3P53978 SAP1YER047C 2694 nt2.87□□□□□ -1.95
HEF3P53978 KAR9YPL269W 1935 nt2.87□□□□□ -1.95
HEF3P53978 DSE4YNR067C 3354 nt2.87□□□□□ -1.95
HEF3P53978 RSN1YMR266W 2862 nt2.86□□□□□ -1.95
HEF3P53978 ATP22YDR350C 2055 nt2.86□□□□□ -1.95
HEF3P53978 SWC4YGR002C 1431 nt2.86□□□□□ -1.95
HEF3P53978 YNL193WYNL193W 1677 nt2.86□□□□□ -1.95
HEF3P53978 YGR228WYGR228W 345 nt2.86□□□□□ -1.95
HEF3P53978 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.86□□□□□ -1.95
HEF3P53978 IST3YIR005W 447 nt2.86□□□□□ -1.95
HEF3P53978 CPR7YJR032W 1182 nt2.86□□□□□ -1.95
HEF3P53978 VPS20YMR077C 666 nt2.86□□□□□ -1.95
HEF3P53978 SAS2YMR127C 1017 nt2.86□□□□□ -1.95
HEF3P53978 UTP15YMR093W 1542 nt2.86□□□□□ -1.95
HEF3P53978 SAP190YKR028W 3102 nt2.86□□□□□ -1.95
HEF3P53978 SKO1YNL167C 1944 nt2.85□□□□□ -1.95
HEF3P53978 MAL33YBR297W 1407 nt2.85□□□□□ -1.95
HEF3P53978 ERG28YER044C 447 nt2.85□□□□□ -1.95
HEF3P53978 YGL159WYGL159W 1113 nt2.85□□□□□ -1.95
HEF3P53978 YJL086CYJL086C 369 nt2.85□□□□□ -1.95
HEF3P53978 ACF4YJR083C 930 nt2.85□□□□□ -1.95
HEF3P53978 YJR141WYJR141W 1044 nt2.85□□□□□ -1.95
HEF3P53978 RPL20AYMR242C 519 nt2.85□□□□□ -1.95
HEF3P53978 RCN2YOR220W 798 nt2.85□□□□□ -1.95
HEF3P53978 RBL2YOR265W 321 nt2.85□□□□□ -1.95
HEF3P53978 ARK1YNL020C 1917 nt2.85□□□□□ -1.95
HEF3P53978 CLN3YAL040C 1743 nt2.85□□□□□ -1.95
HEF3P53978 AFR1YDR085C 1863 nt2.84□□□□□ -1.95
HEF3P53978 snR59snR59 78 nt2.84□□□□□ -1.95
HEF3P53978 YDL187CYDL187C 330 nt2.84□□□□□ -1.95
HEF3P53978 SCEIQ0160 708 nt2.84□□□□□ -1.95
HEF3P53978 MRPL38YKL170W 417 nt2.84□□□□□ -1.95
HEF3P53978 YLR224WYLR224W 1110 nt2.84□□□□□ -1.95
HEF3P53978 PDP3YLR455W 915 nt2.84□□□□□ -1.95
HEF3P53978 YNL203CYNL203C 612 nt2.84□□□□□ -1.95
HEF3P53978 PIS1YPR113W 663 nt2.84□□□□□ -1.95
HEF3P53978 YPR203WYPR203W 309 nt2.84□□□□□ -1.95
HEF3P53978 SWD3YBR175W 948 nt2.84□□□□□ -1.95
HEF3P53978 GAL80YML051W 1308 nt2.84□□□□□ -1.96
HEF3P53978 MLH1YMR167W 2310 nt2.84□□□□□ -1.96
HEF3P53978 SSE1YPL106C 2082 nt2.83□□□□□ -1.96
HEF3P53978 YKL100CYKL100C 1764 nt2.83□□□□□ -1.96
HEF3P53978 VTC1YER072W 390 nt2.83□□□□□ -1.96
HEF3P53978 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.83□□□□□ -1.96
HEF3P53978 YER091C-AYER091C-A 222 nt2.83□□□□□ -1.96
HEF3P53978 GIC1YHR061C 945 nt2.83□□□□□ -1.96
HEF3P53978 COX8YLR395C 237 nt2.83□□□□□ -1.96
HEF3P53978 NGL1YOL042W 1092 nt2.83□□□□□ -1.96
HEF3P53978 SFM1YOR021C 642 nt2.83□□□□□ -1.96
HEF3P53978 TRS20YBR254C 528 nt2.83□□□□□ -1.96
HEF3P53978 ESC1YMR219W 4977 nt2.83□□□□□ -1.96
HEF3P53978 PDR11YIL013C 4236 nt2.83□□□□□ -1.96
HEF3P53978 YFR016CYFR016C 3702 nt2.83□□□□□ -1.96
HEF3P53978 YEL1YBL060W 2064 nt2.83□□□□□ -1.96
HEF3P53978 TFC3YAL001C 3483 nt2.83□□□□□ -1.96
HEF3P53978 YCR090CYCR090C 549 nt2.82□□□□□ -1.96
HEF3P53978 YDL016CYDL016C 303 nt2.82□□□□□ -1.96
HEF3P53978 CSE4YKL049C 690 nt2.82□□□□□ -1.96
HEF3P53978 RRT16YNL105W 429 nt2.82□□□□□ -1.96
HEF3P53978 FLO11YIR019C 4104 nt2.82□□□□□ -1.96
HEF3P53978 AVT2YEL064C 1443 nt2.82□□□□□ -1.96
HEF3P53978 SHE4YOR035C 2370 nt2.82□□□□□ -1.96
HEF3P53978 YCK2YNL154C 1641 nt2.82□□□□□ -1.96
HEF3P53978 YRR1YOR162C 2433 nt2.81□□□□□ -1.96
HEF3P53978 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt2.81□□□□□ -1.96
HEF3P53978 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt2.81□□□□□ -1.96
HEF3P53978 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt2.81□□□□□ -1.96
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