Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP3M2P53677 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP3M2P53677 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms