Protein–RNA interactions for Protein: P51160

PDE6C, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6CP51160 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE6CP51160 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE6CP51160 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms