Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPFP49454 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPFP49454 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPFP49454 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPFP49454 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPFP49454 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPFP49454 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPFP49454 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPFP49454 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPFP49454 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPFP49454 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPFP49454 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPFP49454 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPFP49454 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPFP49454 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPFP49454 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPFP49454 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPFP49454 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPFP49454 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPFP49454 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPFP49454 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPFP49454 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPFP49454 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPFP49454 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPFP49454 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPFP49454 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPFP49454 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPFP49454 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPFP49454 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPFP49454 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPFP49454 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPFP49454 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPFP49454 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPFP49454 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPFP49454 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPFP49454 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPFP49454 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPFP49454 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPFP49454 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPFP49454 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPFP49454 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPFP49454 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPFP49454 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPFP49454 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPFP49454 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CENPFP49454 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CENPFP49454 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPFP49454 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPFP49454 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPFP49454 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPFP49454 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPFP49454 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPFP49454 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPFP49454 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPFP49454 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPFP49454 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPFP49454 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPFP49454 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPFP49454 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPFP49454 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPFP49454 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPFP49454 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPFP49454 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPFP49454 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPFP49454 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPFP49454 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPFP49454 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPFP49454 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPFP49454 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPFP49454 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPFP49454 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPFP49454 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPFP49454 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPFP49454 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPFP49454 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPFP49454 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPFP49454 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPFP49454 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPFP49454 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPFP49454 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPFP49454 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPFP49454 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPFP49454 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPFP49454 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPFP49454 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPFP49454 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPFP49454 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPFP49454 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPFP49454 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPFP49454 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPFP49454 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPFP49454 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPFP49454 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPFP49454 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPFP49454 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPFP49454 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPFP49454 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPFP49454 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPFP49454 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPFP49454 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms