Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC11A1P49279 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms