Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ME1P48163 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ME1P48163 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ME1P48163 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ME1P48163 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ME1P48163 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ME1P48163 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ME1P48163 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ME1P48163 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ME1P48163 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ME1P48163 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ME1P48163 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ME1P48163 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ME1P48163 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ME1P48163 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ME1P48163 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ME1P48163 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ME1P48163 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ME1P48163 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ME1P48163 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ME1P48163 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ME1P48163 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ME1P48163 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ME1P48163 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ME1P48163 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ME1P48163 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ME1P48163 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ME1P48163 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ME1P48163 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ME1P48163 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ME1P48163 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ME1P48163 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ME1P48163 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ME1P48163 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ME1P48163 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ME1P48163 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ME1P48163 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ME1P48163 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ME1P48163 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ME1P48163 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ME1P48163 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ME1P48163 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ME1P48163 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ME1P48163 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ME1P48163 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ME1P48163 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ME1P48163 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ME1P48163 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ME1P48163 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ME1P48163 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ME1P48163 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ME1P48163 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ME1P48163 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ME1P48163 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ME1P48163 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ME1P48163 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ME1P48163 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ME1P48163 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ME1P48163 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ME1P48163 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ME1P48163 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ME1P48163 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ME1P48163 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ME1P48163 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ME1P48163 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ME1P48163 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ME1P48163 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ME1P48163 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ME1P48163 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ME1P48163 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ME1P48163 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ME1P48163 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ME1P48163 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ME1P48163 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ME1P48163 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ME1P48163 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ME1P48163 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ME1P48163 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ME1P48163 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ME1P48163 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ME1P48163 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ME1P48163 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ME1P48163 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ME1P48163 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ME1P48163 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ME1P48163 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ME1P48163 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ME1P48163 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ME1P48163 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ME1P48163 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ME1P48163 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ME1P48163 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ME1P48163 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ME1P48163 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ME1P48163 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ME1P48163 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ME1P48163 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ME1P48163 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ME1P48163 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ME1P48163 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms