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Protein–RNA interactions for Protein: P47050
RTT101, Cullin-8, yeast
Predictions only
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842 aa
.
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
RTT101
P47050
YGR067C
YGR067C
2415 nt
2.78
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
YAT2
YER024W
2772 nt
2.78
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
NDT80
YHR124W
1884 nt
2.77
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
MOT1
YPL082C
5604 nt
2.77
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
MPS1
YDL028C
2295 nt
2.77
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
BNA4
YBL098W
1383 nt
2.77
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
RSN1
YMR266W
2862 nt
2.77
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
CHS3
YBR023C
3498 nt
2.77
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
RSM24
YDR175C
960 nt
2.77
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
YDR250C
YDR250C
276 nt
2.77
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
YER084W-A
YER084W-A
513 nt
2.77
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
AFB1
YLR040C
675 nt
2.77
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
YLR154W-F
YLR154W-F
141 nt
2.77
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
YLR171W
YLR171W
390 nt
2.77
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
PBI2
YNL015W
228 nt
2.77
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
RPL16B
YNL069C
597 nt
2.77
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
SVS1
YPL163C
783 nt
2.77
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
MRPL40
YPL173W
894 nt
2.77
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
YPR096C
YPR096C
303 nt
2.77
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
PIS1
YPR113W
663 nt
2.77
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
RRI2
YOL117W
1938 nt
2.77
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
SPO23
YBR250W
1572 nt
2.77
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
PCK1
YKR097W
1650 nt
2.76
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
GYL1
YMR192W
2163 nt
2.76
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
TOM70
YNL121C
1854 nt
2.76
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
AHC2
YCR082W
387 nt
2.76
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
YDR157W
YDR157W
402 nt
2.76
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
BNA7
YDR428C
786 nt
2.76
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
GIM4
YEL003W
336 nt
2.76
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
RTT105
YER104W
627 nt
2.76
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
VEL1
YGL258W
621 nt
2.76
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
YHR130C
YHR130C
336 nt
2.76
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
YKL044W
YKL044W
321 nt
2.76
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
YLR334C
YLR334C
381 nt
2.76
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
YMR052C-A
YMR052C-A
366 nt
2.76
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
YPL276W
YPL276W
438 nt
2.76
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
YPR012W
YPR012W
255 nt
2.76
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
RRG8
YPR116W
834 nt
2.76
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
YPR170W-A
YPR170W-A
186 nt
2.76
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
snR41
snR41
95 nt
2.76
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
BCK1
YJL095W
4437 nt
2.76
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
PDC2
YDR081C
2778 nt
2.76
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
MSH4
YFL003C
2637 nt
2.75
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
MNT3
YIL014W
1893 nt
2.75
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
CBS1
YDL069C
690 nt
2.75
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
HNT1
YDL125C
477 nt
2.75
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
IRC2
YDR112W
309 nt
2.75
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
YDR114C
YDR114C
303 nt
2.75
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
SPO13
YHR014W
876 nt
2.75
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
JIP3
YLR331C
378 nt
2.75
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
YMR304C-A
YMR304C-A
351 nt
2.75
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
IGO1
YNL157W
507 nt
2.75
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
YPL261C
YPL261C
309 nt
2.75
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
YPR203W
YPR203W
309 nt
2.75
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
MET5
YJR137C
4329 nt
2.75
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
EAP1
YKL204W
1899 nt
2.75
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
YDR338C
YDR338C
2088 nt
2.75
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
JSN1
YJR091C
3276 nt
2.74
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
MUS81
YDR386W
1899 nt
2.74
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
snR70
snR70
164 nt
2.74
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
BI2
Q0110
1272 nt
2.74
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
YGR053C
YGR053C
852 nt
2.74
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
RPS22A
YJL190C
393 nt
2.74
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
COX8
YLR395C
237 nt
2.74
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
YMR013C-A
YMR013C-A
150 nt
2.74
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
FYV12
YOR183W
390 nt
2.74
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
MAL33
YBR297W
1407 nt
2.74
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
SLP1
YOR154W
1764 nt
2.74
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
HFM1
YGL251C
3564 nt
2.74
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
YRR1
YOR162C
2433 nt
2.73
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
DBF20
YPR111W
1695 nt
2.73
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
YER119C-A
YER119C-A
372 nt
2.73
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
PNC1
YGL037C
651 nt
2.73
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
YAP3
YHL009C
993 nt
2.73
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
tW(CCA)G1
tW(CCA)G1
72 nt
2.73
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
tW(CCA)G2
tW(CCA)G2
72 nt
2.73
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
tW(CCA)J
tW(CCA)J
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2.73
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
tW(CCA)K
tW(CCA)K
72 nt
2.73
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
tW(CCA)M
tW(CCA)M
72 nt
2.73
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
tW(CCA)P
tW(CCA)P
72 nt
2.73
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
DAD2
YKR083C
402 nt
2.73
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
ADI1
YMR009W
540 nt
2.73
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
DDR48
YMR173W
1293 nt
2.73
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
SFM1
YOR021C
642 nt
2.73
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
AIM4
YBR194W
372 nt
2.73
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
EXO84
YBR102C
2262 nt
2.72
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
TOM1
YDR457W
9807 nt
2.72
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
CWH41
YGL027C
2502 nt
2.72
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
YCR090C
YCR090C
549 nt
2.72
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
YDR524W-C
YDR524W-C
90 nt
2.72
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
YER091C-A
YER091C-A
222 nt
2.72
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
AGA2
YGL032C
264 nt
2.72
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
SLH1
YGR271W
5904 nt
2.72
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
RPI1
YIL119C
1224 nt
2.72
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
CTK3
YML112W
891 nt
2.72
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
YNL046W
YNL046W
519 nt
2.72
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
YPL142C
YPL142C
318 nt
2.72
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
YLR001C
YLR001C
2589 nt
2.72
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
SSF1
YHR066W
1362 nt
2.72
□□□□□ -1.97
RTT101
P47050
MAK5
YBR142W
2322 nt
2.71
□□□□□ -1.97
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