Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ETV4P43268 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ETV4P43268 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ETV4P43268 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ETV4P43268 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ETV4P43268 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ETV4P43268 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ETV4P43268 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ETV4P43268 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ETV4P43268 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ETV4P43268 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ETV4P43268 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ETV4P43268 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ETV4P43268 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ETV4P43268 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ETV4P43268 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ETV4P43268 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ETV4P43268 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ETV4P43268 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ETV4P43268 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ETV4P43268 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ETV4P43268 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ETV4P43268 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ETV4P43268 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ETV4P43268 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ETV4P43268 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ETV4P43268 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ETV4P43268 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ETV4P43268 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ETV4P43268 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ETV4P43268 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ETV4P43268 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ETV4P43268 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ETV4P43268 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ETV4P43268 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ETV4P43268 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ETV4P43268 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ETV4P43268 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ETV4P43268 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ETV4P43268 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ETV4P43268 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ETV4P43268 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ETV4P43268 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ETV4P43268 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ETV4P43268 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ETV4P43268 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ETV4P43268 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ETV4P43268 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ETV4P43268 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ETV4P43268 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ETV4P43268 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ETV4P43268 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ETV4P43268 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ETV4P43268 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ETV4P43268 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ETV4P43268 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ETV4P43268 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ETV4P43268 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ETV4P43268 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ETV4P43268 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ETV4P43268 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ETV4P43268 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ETV4P43268 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ETV4P43268 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ETV4P43268 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ETV4P43268 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ETV4P43268 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ETV4P43268 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ETV4P43268 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ETV4P43268 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ETV4P43268 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ETV4P43268 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ETV4P43268 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ETV4P43268 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ETV4P43268 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ETV4P43268 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ETV4P43268 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ETV4P43268 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ETV4P43268 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ETV4P43268 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ETV4P43268 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ETV4P43268 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ETV4P43268 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ETV4P43268 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ETV4P43268 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ETV4P43268 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ETV4P43268 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ETV4P43268 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ETV4P43268 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ETV4P43268 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ETV4P43268 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ETV4P43268 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ETV4P43268 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ETV4P43268 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ETV4P43268 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ETV4P43268 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ETV4P43268 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ETV4P43268 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ETV4P43268 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ETV4P43268 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms