Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCAMP43121 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
MCAMP43121 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCAMP43121 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCAMP43121 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCAMP43121 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
MCAMP43121 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCAMP43121 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCAMP43121 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCAMP43121 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCAMP43121 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCAMP43121 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCAMP43121 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCAMP43121 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCAMP43121 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCAMP43121 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCAMP43121 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCAMP43121 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCAMP43121 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCAMP43121 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCAMP43121 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCAMP43121 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCAMP43121 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCAMP43121 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCAMP43121 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCAMP43121 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCAMP43121 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCAMP43121 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCAMP43121 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCAMP43121 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCAMP43121 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MCAMP43121 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCAMP43121 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCAMP43121 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCAMP43121 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MCAMP43121 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCAMP43121 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCAMP43121 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCAMP43121 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCAMP43121 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCAMP43121 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCAMP43121 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCAMP43121 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCAMP43121 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCAMP43121 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCAMP43121 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCAMP43121 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCAMP43121 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCAMP43121 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCAMP43121 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCAMP43121 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCAMP43121 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MCAMP43121 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MCAMP43121 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
MCAMP43121 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MCAMP43121 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MCAMP43121 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MCAMP43121 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
MCAMP43121 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MCAMP43121 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MCAMP43121 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MCAMP43121 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MCAMP43121 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCAMP43121 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCAMP43121 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCAMP43121 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
MCAMP43121 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCAMP43121 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCAMP43121 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCAMP43121 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCAMP43121 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCAMP43121 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCAMP43121 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCAMP43121 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCAMP43121 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
MCAMP43121 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCAMP43121 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCAMP43121 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCAMP43121 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCAMP43121 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCAMP43121 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCAMP43121 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCAMP43121 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCAMP43121 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCAMP43121 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCAMP43121 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCAMP43121 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCAMP43121 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCAMP43121 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCAMP43121 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCAMP43121 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCAMP43121 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCAMP43121 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCAMP43121 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MCAMP43121 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCAMP43121 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCAMP43121 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCAMP43121 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCAMP43121 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MCAMP43121 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms