Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TGFBR1P36897 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms