Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDIT3P35638 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms