Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXD13P35453 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms