Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
THBS4P35443 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
THBS4P35443 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
THBS4P35443 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
THBS4P35443 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
THBS4P35443 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
THBS4P35443 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
THBS4P35443 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
THBS4P35443 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
THBS4P35443 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
THBS4P35443 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
THBS4P35443 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
THBS4P35443 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
THBS4P35443 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
THBS4P35443 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
THBS4P35443 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
THBS4P35443 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
THBS4P35443 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
THBS4P35443 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
THBS4P35443 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
THBS4P35443 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
THBS4P35443 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
THBS4P35443 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
THBS4P35443 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
THBS4P35443 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
THBS4P35443 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
THBS4P35443 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
THBS4P35443 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
THBS4P35443 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
THBS4P35443 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
THBS4P35443 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
THBS4P35443 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
THBS4P35443 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
THBS4P35443 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
THBS4P35443 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
THBS4P35443 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
THBS4P35443 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
THBS4P35443 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
THBS4P35443 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
THBS4P35443 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
THBS4P35443 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
THBS4P35443 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
THBS4P35443 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
THBS4P35443 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
THBS4P35443 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
THBS4P35443 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
THBS4P35443 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
THBS4P35443 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
THBS4P35443 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
THBS4P35443 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
THBS4P35443 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
THBS4P35443 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
THBS4P35443 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
THBS4P35443 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
THBS4P35443 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
THBS4P35443 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
THBS4P35443 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
THBS4P35443 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
THBS4P35443 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
THBS4P35443 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
THBS4P35443 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
THBS4P35443 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
THBS4P35443 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
THBS4P35443 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
THBS4P35443 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
THBS4P35443 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
THBS4P35443 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
THBS4P35443 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
THBS4P35443 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
THBS4P35443 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
THBS4P35443 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
THBS4P35443 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
THBS4P35443 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
THBS4P35443 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
THBS4P35443 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
THBS4P35443 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
THBS4P35443 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
THBS4P35443 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
THBS4P35443 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
THBS4P35443 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
THBS4P35443 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
THBS4P35443 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
THBS4P35443 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
THBS4P35443 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
THBS4P35443 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
THBS4P35443 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
THBS4P35443 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
THBS4P35443 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
THBS4P35443 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
THBS4P35443 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
THBS4P35443 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
THBS4P35443 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
THBS4P35443 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
THBS4P35443 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
THBS4P35443 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
THBS4P35443 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
THBS4P35443 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
THBS4P35443 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
THBS4P35443 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
THBS4P35443 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms