Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJA4P35212 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJA4P35212 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJA4P35212 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GJA4P35212 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJA4P35212 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJA4P35212 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJA4P35212 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJA4P35212 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJA4P35212 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJA4P35212 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJA4P35212 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJA4P35212 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJA4P35212 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJA4P35212 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJA4P35212 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJA4P35212 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJA4P35212 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJA4P35212 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJA4P35212 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJA4P35212 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJA4P35212 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJA4P35212 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJA4P35212 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJA4P35212 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJA4P35212 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GJA4P35212 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJA4P35212 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJA4P35212 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GJA4P35212 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJA4P35212 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJA4P35212 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJA4P35212 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJA4P35212 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJA4P35212 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJA4P35212 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJA4P35212 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJA4P35212 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJA4P35212 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJA4P35212 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJA4P35212 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJA4P35212 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJA4P35212 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJA4P35212 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJA4P35212 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJA4P35212 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJA4P35212 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJA4P35212 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJA4P35212 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJA4P35212 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJA4P35212 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJA4P35212 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJA4P35212 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GJA4P35212 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJA4P35212 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJA4P35212 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJA4P35212 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJA4P35212 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJA4P35212 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJA4P35212 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJA4P35212 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GJA4P35212 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
GJA4P35212 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GJA4P35212 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJA4P35212 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJA4P35212 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJA4P35212 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJA4P35212 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJA4P35212 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJA4P35212 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJA4P35212 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJA4P35212 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJA4P35212 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJA4P35212 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJA4P35212 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJA4P35212 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJA4P35212 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJA4P35212 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJA4P35212 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJA4P35212 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJA4P35212 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GJA4P35212 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJA4P35212 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
GJA4P35212 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJA4P35212 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GJA4P35212 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GJA4P35212 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJA4P35212 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GJA4P35212 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21■□□□□ 0.95
GJA4P35212 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GJA4P35212 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
GJA4P35212 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GJA4P35212 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
GJA4P35212 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GJA4P35212 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21■□□□□ 0.95
GJA4P35212 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GJA4P35212 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJA4P35212 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJA4P35212 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJA4P35212 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms