Protein–RNA interactions for Protein: P32578

SIP1, SNF1 protein kinase subunit beta-1, yeast

Predictions only

Length 815 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SIP1	P32578	YIL175W	YIL175W	318 nt		2.97	□□□□□ -1.93
SIP1	P32578	MRP49	YKL167C	414 nt		2.97	□□□□□ -1.93
SIP1	P32578	LSM2	YBL026W	288 nt		2.97	□□□□□ -1.93
SIP1	P32578	NOP15	YNL110C	663 nt		2.97	□□□□□ -1.93
SIP1	P32578	HEM4	YOR278W	828 nt		2.97	□□□□□ -1.93
SIP1	P32578	RCY1	YJL204C	2523 nt		2.97	□□□□□ -1.93
SIP1	P32578	TOM70	YNL121C	1854 nt		2.96	□□□□□ -1.93
SIP1	P32578	YAT2	YER024W	2772 nt		2.96	□□□□□ -1.94
SIP1	P32578	CDC55	YGL190C	1581 nt		2.96	□□□□□ -1.94
SIP1	P32578	YHR214C-C	YHR214C-C	1437 nt		2.96	□□□□□ -1.94
SIP1	P32578	SSN8	YNL025C	972 nt		2.96	□□□□□ -1.94
SIP1	P32578	SWD3	YBR175W	948 nt		2.96	□□□□□ -1.94
SIP1	P32578	SPP382	YLR424W	2127 nt		2.95	□□□□□ -1.94
SIP1	P32578	EPL1	YFL024C	2499 nt		2.95	□□□□□ -1.94
SIP1	P32578	PSF1	YDR013W	627 nt		2.95	□□□□□ -1.94
SIP1	P32578	YPS5	YGL259W	498 nt		2.95	□□□□□ -1.94
SIP1	P32578	TPM2	YIL138C	486 nt		2.95	□□□□□ -1.94
SIP1	P32578	TEN1	YLR010C	483 nt		2.95	□□□□□ -1.94
SIP1	P32578	YOL150C	YOL150C	312 nt		2.95	□□□□□ -1.94
SIP1	P32578	HSP10	YOR020C	321 nt		2.95	□□□□□ -1.94
SIP1	P32578	YPR014C	YPR014C	330 nt		2.95	□□□□□ -1.94
SIP1	P32578	TRZ1	YKR079C	2517 nt		2.95	□□□□□ -1.94
SIP1	P32578	DUF1	YOL087C	3351 nt		2.95	□□□□□ -1.94
SIP1	P32578	GPI17	YDR434W	1605 nt		2.94	□□□□□ -1.94
SIP1	P32578	UTP13	YLR222C	2454 nt		2.94	□□□□□ -1.94
SIP1	P32578	ERG28	YER044C	447 nt		2.94	□□□□□ -1.94
SIP1	P32578	RPL29	YFR032C-A	180 nt		2.94	□□□□□ -1.94
SIP1	P32578	RRF1	YHR038W	693 nt		2.94	□□□□□ -1.94
SIP1	P32578	CRG1	YHR209W	876 nt		2.94	□□□□□ -1.94
SIP1	P32578	YLR269C	YLR269C	351 nt		2.94	□□□□□ -1.94
SIP1	P32578	UNG1	YML021C	1080 nt		2.94	□□□□□ -1.94
SIP1	P32578	YPL080C	YPL080C	327 nt		2.94	□□□□□ -1.94
SIP1	P32578	snR191	snR191	274 nt		2.94	□□□□□ -1.94
SIP1	P32578	DRS2	YAL026C	4068 nt		2.94	□□□□□ -1.94
SIP1	P32578	MES1	YGR264C	2256 nt		2.94	□□□□□ -1.94
SIP1	P32578	TSC11	YER093C	4293 nt		2.93	□□□□□ -1.94
SIP1	P32578	VTC4	YJL012C	2166 nt		2.93	□□□□□ -1.94
SIP1	P32578	IGO2	YHR132W-A	396 nt		2.93	□□□□□ -1.94
SIP1	P32578	PHD1	YKL043W	1101 nt		2.93	□□□□□ -1.94
SIP1	P32578	YLR230W	YLR230W	306 nt		2.93	□□□□□ -1.94
SIP1	P32578	TFB1	YDR311W	1929 nt		2.93	□□□□□ -1.94
SIP1	P32578	RRM3	YHR031C	2172 nt		2.93	□□□□□ -1.94
SIP1	P32578	DIA2	YOR080W	2199 nt		2.93	□□□□□ -1.94
SIP1	P32578	PSK1	YAL017W	4071 nt		2.92	□□□□□ -1.94
SIP1	P32578	VAS1	YGR094W	3315 nt		2.92	□□□□□ -1.94
SIP1	P32578	ATG31	YDR022C	591 nt		2.92	□□□□□ -1.94
SIP1	P32578	LAG1	YHL003C	1236 nt		2.92	□□□□□ -1.94
SIP1	P32578	IRC19	YLL033W	693 nt		2.92	□□□□□ -1.94
SIP1	P32578	YAL068W-A	YAL068W-A	255 nt		2.92	□□□□□ -1.94
SIP1	P32578	RMP1	YLR145W	606 nt		2.92	□□□□□ -1.94
SIP1	P32578	RFC3	YNL290W	1023 nt		2.92	□□□□□ -1.94
SIP1	P32578	SNF12	YNR023W	1701 nt		2.92	□□□□□ -1.94
SIP1	P32578	VHR2	YER064C	1518 nt		2.92	□□□□□ -1.94
SIP1	P32578	STU2	YLR045C	2667 nt		2.92	□□□□□ -1.94
SIP1	P32578	SPT10	YJL127C	1923 nt		2.91	□□□□□ -1.94
SIP1	P32578	RUD3	YOR216C	1455 nt		2.91	□□□□□ -1.94
SIP1	P32578	BIT61	YJL058C	1632 nt		2.91	□□□□□ -1.94
SIP1	P32578	SWF1	YDR126W	1011 nt		2.91	□□□□□ -1.94
SIP1	P32578	HPA3	YEL066W	540 nt		2.91	□□□□□ -1.94
SIP1	P32578	SMB1	YER029C	591 nt		2.91	□□□□□ -1.94
SIP1	P32578	RNR4	YGR180C	1038 nt		2.91	□□□□□ -1.94
SIP1	P32578	NBL1	YHR199C-A	222 nt		2.91	□□□□□ -1.94
SIP1	P32578	YJR079W	YJR079W	330 nt		2.91	□□□□□ -1.94
SIP1	P32578	YAR047C	YAR047C	321 nt		2.91	□□□□□ -1.94
SIP1	P32578	CDC123	YLR215C	1083 nt		2.91	□□□□□ -1.94
SIP1	P32578	RPB11	YOL005C	363 nt		2.91	□□□□□ -1.94
SIP1	P32578	EXO84	YBR102C	2262 nt		2.91	□□□□□ -1.94
SIP1	P32578	NOP4	YPL043W	2058 nt		2.91	□□□□□ -1.94
SIP1	P32578	SNQ2	YDR011W	4506 nt		2.9	□□□□□ -1.94
SIP1	P32578	RNH70	YGR276C	1662 nt		2.9	□□□□□ -1.95
SIP1	P32578	YEL018C-A	YEL018C-A	534 nt		2.9	□□□□□ -1.95
SIP1	P32578	RTR1	YER139C	681 nt		2.9	□□□□□ -1.95
SIP1	P32578	RAD6	YGL058W	519 nt		2.9	□□□□□ -1.95
SIP1	P32578	FYV4	YHR059W	393 nt		2.9	□□□□□ -1.95
SIP1	P32578	TMA19	YKL056C	504 nt		2.9	□□□□□ -1.95
SIP1	P32578	TIR2	YOR010C	756 nt		2.9	□□□□□ -1.95
SIP1	P32578	YOR029W	YOR029W	336 nt		2.9	□□□□□ -1.95
SIP1	P32578	YBR012C	YBR012C	420 nt		2.9	□□□□□ -1.95
SIP1	P32578	ATG26	YLR189C	3597 nt		2.9	□□□□□ -1.95
SIP1	P32578	YNR063W	YNR063W	1824 nt		2.9	□□□□□ -1.95
SIP1	P32578	BFR1	YOR198C	1413 nt		2.9	□□□□□ -1.95
SIP1	P32578	ATP22	YDR350C	2055 nt		2.89	□□□□□ -1.95
SIP1	P32578	PDC2	YDR081C	2778 nt		2.89	□□□□□ -1.95
SIP1	P32578	YHL006W-A	YHL006W-A	354 nt		2.89	□□□□□ -1.95
SIP1	P32578	YKL066W	YKL066W	444 nt		2.89	□□□□□ -1.95
SIP1	P32578	PEX17	YNL214W	600 nt		2.89	□□□□□ -1.95
SIP1	P32578	YOR053W	YOR053W	342 nt		2.89	□□□□□ -1.95
SIP1	P32578	YBR032W	YBR032W	303 nt		2.89	□□□□□ -1.95
SIP1	P32578	ISU1	YPL135W	498 nt		2.89	□□□□□ -1.95
SIP1	P32578	YBR137W	YBR137W	540 nt		2.89	□□□□□ -1.95
SIP1	P32578	YBR285W	YBR285W	435 nt		2.89	□□□□□ -1.95
SIP1	P32578	RIX1	YHR197W	2292 nt		2.88	□□□□□ -1.95
SIP1	P32578	DYN2	YDR424C	279 nt		2.88	□□□□□ -1.95
SIP1	P32578	RPL30	YGL030W	318 nt		2.88	□□□□□ -1.95
SIP1	P32578	COX23	YHR116W	456 nt		2.88	□□□□□ -1.95
SIP1	P32578	YML084W	YML084W	309 nt		2.88	□□□□□ -1.95
SIP1	P32578	YNL043C	YNL043C	321 nt		2.88	□□□□□ -1.95
SIP1	P32578	CDC33	YOL139C	642 nt		2.88	□□□□□ -1.95
SIP1	P32578	CWC22	YGR278W	1734 nt		2.88	□□□□□ -1.95
SIP1	P32578	MED1	YPR070W	1701 nt		2.88	□□□□□ -1.95

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19.7 ms