Protein–RNA interactions for Protein: P32246

CCR1, C-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR1P32246 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCR1P32246 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCR1P32246 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCR1P32246 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCR1P32246 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCR1P32246 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCR1P32246 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCR1P32246 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCR1P32246 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCR1P32246 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCR1P32246 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCR1P32246 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCR1P32246 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCR1P32246 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCR1P32246 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCR1P32246 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCR1P32246 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCR1P32246 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCR1P32246 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCR1P32246 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCR1P32246 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCR1P32246 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCR1P32246 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCR1P32246 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCR1P32246 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCR1P32246 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCR1P32246 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCR1P32246 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCR1P32246 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCR1P32246 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCR1P32246 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCR1P32246 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCR1P32246 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCR1P32246 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCR1P32246 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCR1P32246 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCR1P32246 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCR1P32246 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCR1P32246 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCR1P32246 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCR1P32246 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCR1P32246 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCR1P32246 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCR1P32246 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCR1P32246 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCR1P32246 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCR1P32246 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCR1P32246 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCR1P32246 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCR1P32246 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCR1P32246 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCR1P32246 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCR1P32246 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCR1P32246 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCR1P32246 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCR1P32246 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCR1P32246 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCR1P32246 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCR1P32246 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCR1P32246 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCR1P32246 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCR1P32246 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCR1P32246 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCR1P32246 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCR1P32246 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCR1P32246 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCR1P32246 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCR1P32246 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCR1P32246 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCR1P32246 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCR1P32246 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCR1P32246 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCR1P32246 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCR1P32246 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCR1P32246 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCR1P32246 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCR1P32246 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCR1P32246 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCR1P32246 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCR1P32246 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCR1P32246 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCR1P32246 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCR1P32246 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCR1P32246 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCR1P32246 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCR1P32246 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCR1P32246 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCR1P32246 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCR1P32246 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCR1P32246 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCR1P32246 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCR1P32246 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCR1P32246 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCR1P32246 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCR1P32246 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCR1P32246 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCR1P32246 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCR1P32246 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCR1P32246 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCR1P32246 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms