Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXA7P31268 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms