Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TNFSF4P23510 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFSF4P23510 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFSF4P23510 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFSF4P23510 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFSF4P23510 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms