Protein–RNA interactions for Protein: P22670

RFX1, MHC class II regulatory factor RFX1, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX1P22670 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFX1P22670 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFX1P22670 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFX1P22670 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFX1P22670 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFX1P22670 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFX1P22670 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RFX1P22670 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFX1P22670 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFX1P22670 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFX1P22670 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFX1P22670 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RFX1P22670 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFX1P22670 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFX1P22670 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFX1P22670 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFX1P22670 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RFX1P22670 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFX1P22670 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFX1P22670 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFX1P22670 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFX1P22670 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFX1P22670 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFX1P22670 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFX1P22670 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFX1P22670 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFX1P22670 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFX1P22670 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFX1P22670 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFX1P22670 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RFX1P22670 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFX1P22670 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFX1P22670 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFX1P22670 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFX1P22670 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFX1P22670 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFX1P22670 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFX1P22670 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFX1P22670 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFX1P22670 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFX1P22670 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
RFX1P22670 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RFX1P22670 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RFX1P22670 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RFX1P22670 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RFX1P22670 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RFX1P22670 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RFX1P22670 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFX1P22670 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFX1P22670 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFX1P22670 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFX1P22670 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFX1P22670 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFX1P22670 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFX1P22670 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFX1P22670 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFX1P22670 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFX1P22670 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFX1P22670 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFX1P22670 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFX1P22670 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFX1P22670 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFX1P22670 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFX1P22670 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RFX1P22670 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFX1P22670 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX1P22670 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX1P22670 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX1P22670 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX1P22670 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX1P22670 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX1P22670 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX1P22670 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX1P22670 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX1P22670 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX1P22670 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX1P22670 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX1P22670 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX1P22670 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX1P22670 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX1P22670 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX1P22670 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX1P22670 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX1P22670 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX1P22670 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX1P22670 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX1P22670 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFX1P22670 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFX1P22670 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFX1P22670 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFX1P22670 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFX1P22670 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFX1P22670 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFX1P22670 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFX1P22670 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFX1P22670 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFX1P22670 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFX1P22670 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFX1P22670 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFX1P22670 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms