Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB1P20618 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB1P20618 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB1P20618 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB1P20618 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB1P20618 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB1P20618 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB1P20618 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB1P20618 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB1P20618 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB1P20618 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB1P20618 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB1P20618 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB1P20618 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB1P20618 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB1P20618 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB1P20618 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB1P20618 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB1P20618 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB1P20618 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB1P20618 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB1P20618 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB1P20618 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB1P20618 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB1P20618 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB1P20618 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB1P20618 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB1P20618 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB1P20618 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB1P20618 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB1P20618 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB1P20618 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB1P20618 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB1P20618 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB1P20618 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB1P20618 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB1P20618 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB1P20618 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB1P20618 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB1P20618 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB1P20618 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB1P20618 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB1P20618 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB1P20618 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB1P20618 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB1P20618 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB1P20618 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB1P20618 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB1P20618 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB1P20618 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB1P20618 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB1P20618 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB1P20618 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB1P20618 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB1P20618 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB1P20618 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB1P20618 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB1P20618 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB1P20618 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB1P20618 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB1P20618 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB1P20618 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB1P20618 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB1P20618 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms