Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DESP17661 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DESP17661 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DESP17661 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DESP17661 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DESP17661 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DESP17661 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DESP17661 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DESP17661 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DESP17661 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DESP17661 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DESP17661 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DESP17661 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DESP17661 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DESP17661 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DESP17661 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DESP17661 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DESP17661 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DESP17661 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DESP17661 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DESP17661 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DESP17661 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DESP17661 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DESP17661 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
DESP17661 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DESP17661 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DESP17661 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DESP17661 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DESP17661 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DESP17661 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DESP17661 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DESP17661 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DESP17661 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DESP17661 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DESP17661 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DESP17661 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DESP17661 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DESP17661 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DESP17661 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DESP17661 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DESP17661 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DESP17661 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DESP17661 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DESP17661 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DESP17661 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DESP17661 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DESP17661 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DESP17661 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DESP17661 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DESP17661 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DESP17661 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DESP17661 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DESP17661 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DESP17661 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DESP17661 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DESP17661 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
DESP17661 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DESP17661 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DESP17661 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DESP17661 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DESP17661 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DESP17661 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
DESP17661 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DESP17661 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DESP17661 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DESP17661 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DESP17661 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DESP17661 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DESP17661 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DESP17661 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DESP17661 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DESP17661 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DESP17661 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DESP17661 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DESP17661 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DESP17661 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
DESP17661 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DESP17661 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
DESP17661 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DESP17661 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DESP17661 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
DESP17661 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DESP17661 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DESP17661 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DESP17661 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DESP17661 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DESP17661 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DESP17661 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DESP17661 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DESP17661 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DESP17661 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DESP17661 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DESP17661 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DESP17661 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
DESP17661 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DESP17661 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DESP17661 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
DESP17661 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DESP17661 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DESP17661 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms