Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-DOBP13765 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms