Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT10P13645 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT10P13645 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT10P13645 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT10P13645 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT10P13645 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT10P13645 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT10P13645 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT10P13645 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT10P13645 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT10P13645 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT10P13645 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT10P13645 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT10P13645 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT10P13645 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT10P13645 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT10P13645 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT10P13645 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT10P13645 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT10P13645 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT10P13645 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT10P13645 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT10P13645 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT10P13645 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT10P13645 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT10P13645 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT10P13645 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT10P13645 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT10P13645 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT10P13645 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT10P13645 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT10P13645 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT10P13645 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT10P13645 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT10P13645 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT10P13645 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT10P13645 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT10P13645 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT10P13645 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT10P13645 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT10P13645 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT10P13645 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT10P13645 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT10P13645 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT10P13645 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT10P13645 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT10P13645 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT10P13645 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT10P13645 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT10P13645 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT10P13645 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT10P13645 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT10P13645 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT10P13645 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT10P13645 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT10P13645 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT10P13645 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT10P13645 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT10P13645 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT10P13645 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT10P13645 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT10P13645 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT10P13645 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT10P13645 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT10P13645 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT10P13645 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT10P13645 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT10P13645 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT10P13645 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT10P13645 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT10P13645 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT10P13645 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT10P13645 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT10P13645 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT10P13645 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT10P13645 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT10P13645 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT10P13645 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT10P13645 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT10P13645 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT10P13645 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT10P13645 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT10P13645 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT10P13645 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT10P13645 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT10P13645 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT10P13645 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT10P13645 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT10P13645 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT10P13645 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT10P13645 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT10P13645 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT10P13645 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT10P13645 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT10P13645 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT10P13645 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT10P13645 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT10P13645 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT10P13645 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT10P13645 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms