Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms