Protein–RNA interactions for Protein: P11055

MYH3, Myosin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH3P11055 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MYH3P11055 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MYH3P11055 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MYH3P11055 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MYH3P11055 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MYH3P11055 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MYH3P11055 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MYH3P11055 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MYH3P11055 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MYH3P11055 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MYH3P11055 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MYH3P11055 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MYH3P11055 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MYH3P11055 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MYH3P11055 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MYH3P11055 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MYH3P11055 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MYH3P11055 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MYH3P11055 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
MYH3P11055 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MYH3P11055 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MYH3P11055 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MYH3P11055 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MYH3P11055 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MYH3P11055 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MYH3P11055 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MYH3P11055 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MYH3P11055 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MYH3P11055 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MYH3P11055 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
MYH3P11055 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MYH3P11055 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MYH3P11055 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MYH3P11055 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MYH3P11055 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MYH3P11055 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MYH3P11055 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MYH3P11055 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MYH3P11055 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MYH3P11055 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MYH3P11055 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MYH3P11055 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MYH3P11055 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MYH3P11055 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MYH3P11055 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MYH3P11055 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MYH3P11055 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MYH3P11055 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MYH3P11055 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MYH3P11055 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MYH3P11055 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MYH3P11055 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MYH3P11055 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MYH3P11055 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MYH3P11055 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MYH3P11055 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MYH3P11055 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MYH3P11055 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MYH3P11055 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MYH3P11055 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MYH3P11055 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MYH3P11055 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MYH3P11055 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MYH3P11055 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MYH3P11055 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MYH3P11055 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MYH3P11055 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MYH3P11055 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MYH3P11055 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MYH3P11055 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
MYH3P11055 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
MYH3P11055 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MYH3P11055 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MYH3P11055 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
MYH3P11055 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MYH3P11055 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MYH3P11055 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MYH3P11055 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MYH3P11055 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MYH3P11055 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MYH3P11055 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MYH3P11055 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MYH3P11055 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MYH3P11055 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MYH3P11055 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MYH3P11055 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MYH3P11055 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MYH3P11055 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MYH3P11055 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MYH3P11055 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MYH3P11055 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MYH3P11055 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MYH3P11055 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
MYH3P11055 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
MYH3P11055 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MYH3P11055 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MYH3P11055 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MYH3P11055 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MYH3P11055 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MYH3P11055 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms