Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSF1RP07333 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSF1RP07333 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSF1RP07333 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSF1RP07333 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSF1RP07333 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSF1RP07333 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSF1RP07333 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSF1RP07333 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSF1RP07333 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSF1RP07333 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSF1RP07333 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSF1RP07333 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSF1RP07333 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSF1RP07333 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSF1RP07333 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSF1RP07333 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSF1RP07333 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSF1RP07333 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSF1RP07333 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSF1RP07333 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSF1RP07333 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSF1RP07333 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSF1RP07333 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSF1RP07333 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSF1RP07333 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSF1RP07333 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSF1RP07333 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSF1RP07333 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSF1RP07333 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSF1RP07333 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSF1RP07333 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSF1RP07333 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSF1RP07333 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSF1RP07333 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSF1RP07333 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSF1RP07333 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSF1RP07333 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSF1RP07333 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSF1RP07333 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSF1RP07333 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSF1RP07333 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSF1RP07333 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSF1RP07333 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSF1RP07333 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSF1RP07333 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSF1RP07333 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSF1RP07333 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSF1RP07333 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSF1RP07333 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSF1RP07333 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSF1RP07333 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CSF1RP07333 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSF1RP07333 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms