Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CENPBP07199 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CENPBP07199 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CENPBP07199 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CENPBP07199 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CENPBP07199 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CENPBP07199 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CENPBP07199 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CENPBP07199 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CENPBP07199 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CENPBP07199 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CENPBP07199 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CENPBP07199 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CENPBP07199 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CENPBP07199 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CENPBP07199 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CENPBP07199 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CENPBP07199 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CENPBP07199 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CENPBP07199 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CENPBP07199 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CENPBP07199 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CENPBP07199 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CENPBP07199 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CENPBP07199 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CENPBP07199 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CENPBP07199 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CENPBP07199 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CENPBP07199 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CENPBP07199 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CENPBP07199 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CENPBP07199 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CENPBP07199 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CENPBP07199 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CENPBP07199 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CENPBP07199 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CENPBP07199 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CENPBP07199 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CENPBP07199 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CENPBP07199 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CENPBP07199 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CENPBP07199 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CENPBP07199 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CENPBP07199 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CENPBP07199 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CENPBP07199 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CENPBP07199 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CENPBP07199 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CENPBP07199 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CENPBP07199 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CENPBP07199 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CENPBP07199 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CENPBP07199 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CENPBP07199 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CENPBP07199 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CENPBP07199 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CENPBP07199 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CENPBP07199 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CENPBP07199 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CENPBP07199 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CENPBP07199 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CENPBP07199 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CENPBP07199 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CENPBP07199 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CENPBP07199 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CENPBP07199 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CENPBP07199 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CENPBP07199 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CENPBP07199 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CENPBP07199 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CENPBP07199 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CENPBP07199 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CENPBP07199 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CENPBP07199 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CENPBP07199 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CENPBP07199 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CENPBP07199 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CENPBP07199 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CENPBP07199 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CENPBP07199 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CENPBP07199 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CENPBP07199 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CENPBP07199 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CENPBP07199 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CENPBP07199 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CENPBP07199 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CENPBP07199 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CENPBP07199 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CENPBP07199 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CENPBP07199 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CENPBP07199 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CENPBP07199 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CENPBP07199 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CENPBP07199 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CENPBP07199 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CENPBP07199 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CENPBP07199 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CENPBP07199 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CENPBP07199 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CENPBP07199 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms