Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEFMP07197 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEFMP07197 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEFMP07197 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NEFMP07197 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEFMP07197 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEFMP07197 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEFMP07197 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEFMP07197 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEFMP07197 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEFMP07197 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEFMP07197 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEFMP07197 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEFMP07197 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NEFMP07197 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEFMP07197 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEFMP07197 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEFMP07197 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEFMP07197 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEFMP07197 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEFMP07197 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEFMP07197 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEFMP07197 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEFMP07197 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEFMP07197 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEFMP07197 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEFMP07197 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEFMP07197 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEFMP07197 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEFMP07197 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEFMP07197 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEFMP07197 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEFMP07197 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEFMP07197 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEFMP07197 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEFMP07197 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEFMP07197 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEFMP07197 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEFMP07197 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEFMP07197 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NEFMP07197 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEFMP07197 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NEFMP07197 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEFMP07197 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEFMP07197 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEFMP07197 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEFMP07197 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEFMP07197 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEFMP07197 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEFMP07197 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEFMP07197 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEFMP07197 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEFMP07197 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEFMP07197 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEFMP07197 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEFMP07197 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEFMP07197 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEFMP07197 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEFMP07197 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEFMP07197 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEFMP07197 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEFMP07197 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NEFMP07197 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NEFMP07197 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEFMP07197 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEFMP07197 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEFMP07197 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEFMP07197 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEFMP07197 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
NEFMP07197 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEFMP07197 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEFMP07197 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEFMP07197 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEFMP07197 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEFMP07197 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEFMP07197 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEFMP07197 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEFMP07197 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEFMP07197 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEFMP07197 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEFMP07197 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEFMP07197 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEFMP07197 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEFMP07197 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEFMP07197 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEFMP07197 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEFMP07197 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEFMP07197 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEFMP07197 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEFMP07197 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
NEFMP07197 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEFMP07197 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEFMP07197 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEFMP07197 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEFMP07197 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEFMP07197 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEFMP07197 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEFMP07197 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEFMP07197 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEFMP07197 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms