Protein–RNA interactions for Protein: O75534

CSDE1, Cold shock domain-containing protein E1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1O75534 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms