Protein–RNA interactions for Protein: O75346

ZNF253, Zinc finger protein 253, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF253O75346 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF253O75346 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF253O75346 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms