Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB11FIP3O75154 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms