Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG13O75143 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG13O75143 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG13O75143 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG13O75143 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG13O75143 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG13O75143 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG13O75143 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG13O75143 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG13O75143 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG13O75143 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG13O75143 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG13O75143 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG13O75143 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG13O75143 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG13O75143 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG13O75143 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG13O75143 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG13O75143 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG13O75143 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG13O75143 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG13O75143 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG13O75143 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG13O75143 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG13O75143 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG13O75143 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG13O75143 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG13O75143 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG13O75143 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG13O75143 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG13O75143 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG13O75143 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG13O75143 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG13O75143 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG13O75143 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG13O75143 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ATG13O75143 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG13O75143 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG13O75143 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG13O75143 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG13O75143 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG13O75143 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG13O75143 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG13O75143 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG13O75143 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG13O75143 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG13O75143 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG13O75143 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG13O75143 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG13O75143 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG13O75143 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG13O75143 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG13O75143 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG13O75143 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG13O75143 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG13O75143 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG13O75143 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG13O75143 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG13O75143 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG13O75143 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG13O75143 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG13O75143 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG13O75143 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG13O75143 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG13O75143 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ATG13O75143 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATG13O75143 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ATG13O75143 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATG13O75143 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATG13O75143 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ATG13O75143 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATG13O75143 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ATG13O75143 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ATG13O75143 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ATG13O75143 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ATG13O75143 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATG13O75143 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATG13O75143 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ATG13O75143 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ATG13O75143 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATG13O75143 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ATG13O75143 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ATG13O75143 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG13O75143 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG13O75143 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG13O75143 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG13O75143 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG13O75143 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG13O75143 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG13O75143 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG13O75143 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG13O75143 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG13O75143 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG13O75143 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG13O75143 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG13O75143 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG13O75143 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG13O75143 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG13O75143 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG13O75143 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms