Protein–RNA interactions for Protein: O60563

CCNT1, Cyclin-T1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNT1O60563 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNT1O60563 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNT1O60563 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNT1O60563 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNT1O60563 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNT1O60563 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNT1O60563 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNT1O60563 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNT1O60563 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms