Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COCHO43405 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COCHO43405 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COCHO43405 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COCHO43405 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COCHO43405 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COCHO43405 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
COCHO43405 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COCHO43405 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COCHO43405 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COCHO43405 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COCHO43405 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COCHO43405 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COCHO43405 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
COCHO43405 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COCHO43405 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COCHO43405 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COCHO43405 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COCHO43405 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COCHO43405 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COCHO43405 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COCHO43405 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COCHO43405 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COCHO43405 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
COCHO43405 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
COCHO43405 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
COCHO43405 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
COCHO43405 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
COCHO43405 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
COCHO43405 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COCHO43405 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COCHO43405 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COCHO43405 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COCHO43405 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COCHO43405 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COCHO43405 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COCHO43405 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COCHO43405 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COCHO43405 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COCHO43405 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COCHO43405 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COCHO43405 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COCHO43405 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COCHO43405 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COCHO43405 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COCHO43405 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COCHO43405 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
COCHO43405 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COCHO43405 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COCHO43405 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COCHO43405 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COCHO43405 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COCHO43405 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COCHO43405 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COCHO43405 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
COCHO43405 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COCHO43405 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COCHO43405 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COCHO43405 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COCHO43405 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COCHO43405 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COCHO43405 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COCHO43405 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COCHO43405 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COCHO43405 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COCHO43405 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COCHO43405 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COCHO43405 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COCHO43405 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
COCHO43405 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COCHO43405 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COCHO43405 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COCHO43405 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COCHO43405 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COCHO43405 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COCHO43405 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COCHO43405 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COCHO43405 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COCHO43405 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COCHO43405 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COCHO43405 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COCHO43405 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COCHO43405 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COCHO43405 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COCHO43405 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COCHO43405 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COCHO43405 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COCHO43405 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COCHO43405 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COCHO43405 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COCHO43405 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COCHO43405 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COCHO43405 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COCHO43405 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COCHO43405 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COCHO43405 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COCHO43405 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COCHO43405 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COCHO43405 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
COCHO43405 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms