Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1O43347 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSI1O43347 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSI1O43347 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSI1O43347 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
MSI1O43347 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSI1O43347 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSI1O43347 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSI1O43347 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSI1O43347 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MSI1O43347 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSI1O43347 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSI1O43347 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSI1O43347 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSI1O43347 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSI1O43347 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSI1O43347 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSI1O43347 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSI1O43347 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSI1O43347 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSI1O43347 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSI1O43347 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
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MSI1O43347 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MSI1O43347 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSI1O43347 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSI1O43347 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSI1O43347 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSI1O43347 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSI1O43347 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSI1O43347 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSI1O43347 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSI1O43347 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSI1O43347 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSI1O43347 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSI1O43347 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSI1O43347 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSI1O43347 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSI1O43347 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSI1O43347 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSI1O43347 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSI1O43347 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSI1O43347 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSI1O43347 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSI1O43347 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSI1O43347 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSI1O43347 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSI1O43347 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
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MSI1O43347 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MSI1O43347 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSI1O43347 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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MSI1O43347 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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MSI1O43347 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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MSI1O43347 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSI1O43347 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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MSI1O43347 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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MSI1O43347 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSI1O43347 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSI1O43347 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSI1O43347 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSI1O43347 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSI1O43347 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSI1O43347 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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MSI1O43347 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSI1O43347 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSI1O43347 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSI1O43347 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSI1O43347 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSI1O43347 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSI1O43347 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSI1O43347 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSI1O43347 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSI1O43347 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSI1O43347 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSI1O43347 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSI1O43347 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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