Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA3EO15041 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA3EO15041 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms