Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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