Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms