Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms