Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NOTOA8MTQ0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms