Protein–RNA interactions for Protein: A6NDK9

GOLGA6C, Golgin subfamily A member 6C, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6CA6NDK9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6CA6NDK9 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms