Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS37CA5D8V6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS37CA5D8V6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms