Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms