Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 AL079304.1-201ENST00000554595 828 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AC112236.1-201ENST00000561977 1098 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AL354809.1-202ENST00000614005 640 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 ALOX5AP-203ENST00000617770 1224 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AL354809.1-201ENST00000618106 716 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AP000962.2-201ENST00000624971 1101 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AL035660.2-202ENST00000641233 242 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 CD59-202ENST00000395850 1889 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AC117945.2-201ENST00000642109 1521 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 CHODL-204ENST00000400128 2421 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 GPATCH11-202ENST00000409774 3906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 COL10A1-201ENST00000243222 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AC012354.1-201ENST00000425325 2685 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 PAQR8-201ENST00000360726 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 MCTP1-202ENST00000429576 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 ERC1-225ENST00000611180 2832 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 ANKRD1-201ENST00000371697 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 CNTNAP3B-211ENST00000612828 7455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AIG1-202ENST00000357847 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 SGK1-211ENST00000475719 1383 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 NELL2-212ENST00000549027 3036 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 ADIPOQ-201ENST00000320741 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 SLC22A24-203ENST00000612278 2101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 CABIN1-214ENST00000617531 7072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 SPACA5B-201ENST00000304270 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 CDC23-201ENST00000394884 1079 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 PTMAP4-201ENST00000426188 346 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 IMP3P1-201ENST00000427532 557 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AC022400.1-201ENST00000434147 445 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 SEZ6-204ENST00000442608 3805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 RBMX2P1-201ENST00000454795 836 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 PPIAP11-201ENST00000510729 493 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AC064862.6-201ENST00000511350 459 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 IL22-202ENST00000538666 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AC079907.2-201ENST00000550307 1034 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 Metazoa_SRP.12-201ENST00000553249 268 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AF111167.1-201ENST00000555909 704 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AL079307.2-201ENST00000557308 448 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AC103810.2-201ENST00000577938 559 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 MIR4274-201ENST00000579577 91 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 ZNF93-205ENST00000591366 590 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 TUSC8-202ENST00000607312 628 ntTSL 4 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AC005291.2-201ENST00000609088 523 ntTSL 4 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 MIR6511A2-201ENST00000611011 67 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 BSNDP1-201ENST00000613026 367 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 MIR6511A3-201ENST00000615389 67 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 MIR6511A4-201ENST00000615860 67 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 MIR6511A1-201ENST00000617664 67 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AC136603.1-201ENST00000625152 767 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AC044839.1-208ENST00000634902 917 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 LDB2-201ENST00000304523 2548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 CSGALNACT1-203ENST00000454498 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 SLC12A3-203ENST00000563236 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 GTF2IP1-205ENST00000618412 2990 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 APTX-207ENST00000397172 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 CCDC190-201ENST00000367910 1498 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 SLC24A4-201ENST00000393265 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 TKTL2-201ENST00000280605 2654 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 CHFR-201ENST00000266880 11133 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 ATP7B-205ENST00000418097 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 ALOX12P2-210ENST00000574727 4326 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 WEE2-AS1-209ENST00000488785 2262 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 KIF24-202ENST00000402558 6131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 BCAT1-201ENST00000261192 9674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 SERPINC1-201ENST00000367698 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 PHTF2-205ENST00000416283 5198 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 LINC00858-201ENST00000415469 2685 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 PDZPH1P-201ENST00000412514 1783 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 PAX5-201ENST00000358127 8615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 HVCN1-207ENST00000548312 1301 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 UTY-215ENST00000618474 6277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 C1orf198-202ENST00000427697 3666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 CNBD2-205ENST00000538900 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 ZNF473-202ENST00000391821 4715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 KCNMA1-259ENST00000639406 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 ZNF684-202ENST00000372697 1028 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 AL121892.1-201ENST00000422574 833 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 FYTTD1P1-201ENST00000424250 921 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 AC145543.1-201ENST00000424770 586 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 AL023653.1-201ENST00000432513 326 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 LINC01823-203ENST00000435895 766 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 AC108488.1-205ENST00000438482 914 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 VDAC1P4-201ENST00000450197 835 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 AC008696.1-201ENST00000502593 615 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 AC092435.1-201ENST00000513711 443 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 AC022034.4-201ENST00000521930 469 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 AP000424.1-202ENST00000523831 331 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 OR7E11P-201ENST00000532901 952 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 DAD1-204ENST00000538631 441 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 OAS1-211ENST00000553185 664 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 AC124248.1-201ENST00000558221 402 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 AC092119.1-201ENST00000562640 934 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 AC141586.2-201ENST00000565111 572 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 AC093525.5-201ENST00000569220 572 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 AC015853.1-201ENST00000574008 592 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 AC005154.1-230ENST00000578994 644 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 RN7SL557P-201ENST00000581047 286 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 MIR4327-201ENST00000581194 85 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 AC018761.3-201ENST00000590065 388 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 RNA5SP357-201ENST00000607318 119 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
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